乙肝至今仍没有办法治愈，除了病情复杂、清除乙肝病毒的药物没有发明等原因外，没能完全搞明白致病机理，也是重要原因。
目前，采用口服乙肝药物治疗的患者，占了大多数。恩替卡韦是肝科医生和乙肝患者熟悉的药物，具有抑制病毒药效很强、副作用很小、耐药率较低、长期服用安全等特点，属于抗病毒治疗一线用药。
但即使服用恩替卡韦，也只能抑制病毒复制，不少初治患者连续吃24—48周后，病情可得到控制，主要是免疫清除引起的炎症降低，肝功逐步恢复正常。如果再连续服药1—2年，一些患者的乙肝病毒DNA也低于检测线了，但并不意味着乙肝病毒已经清除，只是恩替卡韦将其压制了。选择使用恩替卡韦治疗乙肝，是一个较长的过程，患者要有心理准备。
乙肝病毒在人体免疫系统尚未发育和完善的时候，溜进肝脏内部，病毒DNA向肝细胞核靠拢，形成非常稳定、顽固的乙肝病毒母体，又叫“cccDNA”，现有的乙肝药物，含恩替卡韦在内，均不能深入细胞核内将其根除。
乙肝病毒母体藏在肝细胞核内，如同吸附的“寄生虫”，借助肝脏有利的生长环境和自带的病毒“模板”，大量复制病毒。由于人体免疫系统处于学习摸索阶段，误认为乙肝病毒是“自己人”，乙肝病毒拥有长时间的“黄金发展期”。
等到某个阶段，免疫系统觉醒和成熟了，会尝试清除乙肝病毒，但清除的地点，是在肝脏内部。免疫系统派出的免疫细胞，不分敌友，不管是健康肝细胞还是粘附乙肝病毒的肝细胞，一起消灭了，导致乙肝病毒清除的同时，肝细胞也同步损伤，肝脏炎症就这样发生了。
为了阻止和延缓炎症进程，在合适的时机用药物抗病毒治疗，如选用恩替卡韦，口服后转化为三磷酸盐，与乙肝病毒大规模复制必需的“多聚酶”结合，多聚酶催化作用丧失，这样乙肝复制病毒效率受阻、减缓，免疫系统清除导致的肝损伤减少，肝功慢慢回到正常范围。随着乙肝复制病毒的整体数量一点点减少，一段时间后乙肝病毒DNA低于检测线了。
肝功能正常，乙肝病毒DNA检测不出，是不是就能停药了？很多肝硬化、肝癌案例警示乙肝患者：还没到时机，还要坚持吃药。虽然恩替卡韦不能消灭cccDNA，但可以通过长期服用，同时依靠免疫系统清除、肝脏代谢，终会有一天把乙肝病毒耗没了，这个过程比较长，乙肝病毒母体的生命周期是14年以上，所以吃恩替卡韦十多年并不少见。
研究发现，有的患者选准了抗病毒时机，加上自身的身体条件不错，治疗较规范，有的5年左右就可安全停药了，不用长时间吃恩替卡韦。
遵医嘱可以安全停药的4种情形，缺一不可：
从检查结果看，患者转氨酶正常，乙肝病毒DNA检不出，体内产生E抗体，E抗原消失，此后每半年检查1次，结果正常，连续4次均如此。
从患者抗病毒史看，患者开始治疗时未超过30岁，没有乙肝药物耐药史。且服药后，大三阳转为小三阳的时间最好在6个月以内。
从患者病史的家族史看，患者未发现其他合并肝炎，如丙肝、丁肝；无肝病家族史，直系亲属无肝癌。
从患者的服药管理看，患者严格按要求吃恩替卡韦，没有因滥用其他药物引起的肝损伤问题。
这4条停药的“硬要求”很严格，大部分患者逐项对比后，其实达不到，只能长期服药较为稳妥。切记不可擅自停药，否则病情会在短时间反弹，而且会比之前更严重。
医生强调需要长期服药、不能轻易停药的情形：
乙肝患者已确诊肝硬化，或乙肝病毒传播途径是母婴垂直传播，共同特点是乙肝病毒较顽固，前者要终生服药，后者乙肝病毒母体很难清除。
服用恩替卡韦，如果选择进口药，每月价格约在—元之间，选用国产仿制药，含分散片、胶囊等，每月费用有的已降至5元以下，多数在10—50元以内，比较便利。进口药和仿制药的药效，没有明显差别。
恩替卡韦长期服用比较安全，抗病毒治疗有效抑制病情，小部分患者能临床治愈，更多的患者，是等到治愈乙肝药物发明后，看到曙光。